UPT BPMKP Provinsi Sulawesi Selatan menerapkan sistem mutu berdasarkan pada Pedoman SNI/IEC ISO GUIDE 9001:2015 tentang Sistem Manajemen Mutu dan SNI/IEC ISO GUIDE 17065; 2012 tentang Penilaian Keseuaian dalam rangka memberikan pelayanan sertifikasi, registrasi dan pelabelan produk pertanian segar yang mengutamakan mutu dan kepuasan Pemohon serta menjamin bahwa pekerjaan dilaksanakan dengan cepat dan tepat serta efisien dalam menggunakan sumber daya.

Dalam memberikan pelayanan, BPMKP PROV.SULSEL tidak membedakan asal dan jumlah sertifikat atau nomor register yang dimiliki Pemohon. BPMKP PROV.SULSEL melaksanakan sistem secara independen, bebas dari tekanan komersial dan konflik kepentingan pribadi serta segala tekanan lain. Seluruh informasi terjamin kerahasiaannya.